如果避免了预扩增，数据可转换成绝对的cDNA数量，否则数据分析可以Cq值来开展，因为每个细胞的转录本水平呈对数正态分布。一开始，可以各种方法对数据作图，此外，基本的统计分析也应开展（如阳性细胞的数量、平均值和偏差）。细胞数量测定通常是以验证过的参考基因来均一化的。这种策略在单细胞分析中应避免，因为单个细胞中的所有转录本水平随时间变化。我们发现，校正分析和无监督算法（如Kohonen self-organizing maps）对定义亚群和基因网络很有用。Finn-Arne Weltzien（挪威兽医学院）

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